Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTX3P26022 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTX3P26022 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTX3P26022 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTX3P26022 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTX3P26022 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTX3P26022 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTX3P26022 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTX3P26022 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTX3P26022 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTX3P26022 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTX3P26022 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTX3P26022 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTX3P26022 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTX3P26022 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTX3P26022 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTX3P26022 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTX3P26022 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTX3P26022 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTX3P26022 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTX3P26022 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTX3P26022 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTX3P26022 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTX3P26022 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTX3P26022 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTX3P26022 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTX3P26022 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTX3P26022 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTX3P26022 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTX3P26022 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTX3P26022 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTX3P26022 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTX3P26022 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTX3P26022 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTX3P26022 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTX3P26022 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTX3P26022 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTX3P26022 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTX3P26022 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTX3P26022 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTX3P26022 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTX3P26022 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTX3P26022 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTX3P26022 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTX3P26022 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTX3P26022 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTX3P26022 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTX3P26022 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTX3P26022 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTX3P26022 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTX3P26022 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTX3P26022 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTX3P26022 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTX3P26022 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTX3P26022 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTX3P26022 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTX3P26022 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTX3P26022 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTX3P26022 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTX3P26022 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTX3P26022 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTX3P26022 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTX3P26022 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTX3P26022 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTX3P26022 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTX3P26022 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTX3P26022 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTX3P26022 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTX3P26022 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTX3P26022 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTX3P26022 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTX3P26022 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTX3P26022 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTX3P26022 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTX3P26022 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTX3P26022 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTX3P26022 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTX3P26022 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTX3P26022 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTX3P26022 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTX3P26022 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTX3P26022 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTX3P26022 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTX3P26022 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTX3P26022 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTX3P26022 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTX3P26022 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTX3P26022 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTX3P26022 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTX3P26022 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTX3P26022 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTX3P26022 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTX3P26022 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTX3P26022 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTX3P26022 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTX3P26022 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTX3P26022 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTX3P26022 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTX3P26022 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTX3P26022 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms