Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KDELR1P24390 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR1P24390 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms