Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP24386 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP24386 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHMP24386 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP24386 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP24386 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP24386 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP24386 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP24386 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP24386 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP24386 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHMP24386 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP24386 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP24386 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP24386 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP24386 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP24386 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP24386 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP24386 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP24386 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP24386 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP24386 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHMP24386 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHMP24386 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP24386 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP24386 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP24386 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP24386 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP24386 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP24386 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP24386 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP24386 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP24386 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP24386 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP24386 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHMP24386 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHMP24386 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHMP24386 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHMP24386 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP24386 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP24386 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP24386 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP24386 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP24386 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP24386 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP24386 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP24386 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP24386 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP24386 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP24386 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP24386 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP24386 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP24386 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP24386 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP24386 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP24386 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP24386 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP24386 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP24386 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP24386 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP24386 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP24386 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP24386 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP24386 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP24386 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP24386 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP24386 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP24386 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP24386 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP24386 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP24386 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP24386 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP24386 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP24386 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP24386 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP24386 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP24386 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP24386 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP24386 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP24386 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP24386 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP24386 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP24386 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP24386 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP24386 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP24386 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP24386 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP24386 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP24386 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP24386 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP24386 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP24386 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP24386 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP24386 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP24386 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP24386 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP24386 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP24386 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP24386 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP24386 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms