Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGA6P23229 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGA6P23229 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms