Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms