Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA5P22460 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms