Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGFR4P22455 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms