Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MATN1P21941 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MATN1P21941 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MATN1P21941 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MATN1P21941 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MATN1P21941 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MATN1P21941 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MATN1P21941 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MATN1P21941 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MATN1P21941 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MATN1P21941 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MATN1P21941 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MATN1P21941 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MATN1P21941 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MATN1P21941 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MATN1P21941 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MATN1P21941 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MATN1P21941 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MATN1P21941 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MATN1P21941 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MATN1P21941 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MATN1P21941 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MATN1P21941 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MATN1P21941 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MATN1P21941 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MATN1P21941 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MATN1P21941 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MATN1P21941 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MATN1P21941 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MATN1P21941 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MATN1P21941 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MATN1P21941 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MATN1P21941 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MATN1P21941 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MATN1P21941 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MATN1P21941 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MATN1P21941 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MATN1P21941 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MATN1P21941 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MATN1P21941 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MATN1P21941 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MATN1P21941 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MATN1P21941 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MATN1P21941 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MATN1P21941 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MATN1P21941 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MATN1P21941 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MATN1P21941 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MATN1P21941 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MATN1P21941 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MATN1P21941 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MATN1P21941 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MATN1P21941 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MATN1P21941 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MATN1P21941 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MATN1P21941 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MATN1P21941 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MATN1P21941 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MATN1P21941 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MATN1P21941 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MATN1P21941 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MATN1P21941 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MATN1P21941 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MATN1P21941 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MATN1P21941 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MATN1P21941 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MATN1P21941 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MATN1P21941 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MATN1P21941 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MATN1P21941 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MATN1P21941 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN1P21941 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN1P21941 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN1P21941 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN1P21941 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN1P21941 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN1P21941 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN1P21941 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN1P21941 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN1P21941 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN1P21941 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN1P21941 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN1P21941 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN1P21941 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN1P21941 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN1P21941 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MATN1P21941 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MATN1P21941 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MATN1P21941 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MATN1P21941 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MATN1P21941 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MATN1P21941 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MATN1P21941 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MATN1P21941 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MATN1P21941 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MATN1P21941 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MATN1P21941 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MATN1P21941 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MATN1P21941 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MATN1P21941 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms