Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NR1D1P20393 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms