Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI1P19237 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms