Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRAP18433 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
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