Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC2P18074 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC2P18074 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC2P18074 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms