Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STMN1P16949 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STMN1P16949 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STMN1P16949 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STMN1P16949 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STMN1P16949 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STMN1P16949 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STMN1P16949 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STMN1P16949 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STMN1P16949 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STMN1P16949 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STMN1P16949 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STMN1P16949 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STMN1P16949 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STMN1P16949 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STMN1P16949 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STMN1P16949 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STMN1P16949 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STMN1P16949 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STMN1P16949 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STMN1P16949 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STMN1P16949 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STMN1P16949 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STMN1P16949 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STMN1P16949 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STMN1P16949 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STMN1P16949 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STMN1P16949 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STMN1P16949 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STMN1P16949 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STMN1P16949 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STMN1P16949 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STMN1P16949 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STMN1P16949 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STMN1P16949 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STMN1P16949 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STMN1P16949 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STMN1P16949 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STMN1P16949 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STMN1P16949 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STMN1P16949 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STMN1P16949 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STMN1P16949 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STMN1P16949 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STMN1P16949 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STMN1P16949 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STMN1P16949 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STMN1P16949 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STMN1P16949 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STMN1P16949 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STMN1P16949 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STMN1P16949 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STMN1P16949 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STMN1P16949 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STMN1P16949 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STMN1P16949 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STMN1P16949 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STMN1P16949 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STMN1P16949 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STMN1P16949 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STMN1P16949 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STMN1P16949 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STMN1P16949 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STMN1P16949 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STMN1P16949 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STMN1P16949 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STMN1P16949 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STMN1P16949 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STMN1P16949 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STMN1P16949 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STMN1P16949 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STMN1P16949 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STMN1P16949 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STMN1P16949 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STMN1P16949 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STMN1P16949 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STMN1P16949 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STMN1P16949 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STMN1P16949 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STMN1P16949 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STMN1P16949 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STMN1P16949 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STMN1P16949 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STMN1P16949 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STMN1P16949 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STMN1P16949 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STMN1P16949 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STMN1P16949 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STMN1P16949 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STMN1P16949 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STMN1P16949 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STMN1P16949 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STMN1P16949 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STMN1P16949 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STMN1P16949 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STMN1P16949 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STMN1P16949 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STMN1P16949 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STMN1P16949 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STMN1P16949 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms