Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAG1P15918 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAG1P15918 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAG1P15918 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAG1P15918 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAG1P15918 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAG1P15918 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAG1P15918 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAG1P15918 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAG1P15918 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAG1P15918 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAG1P15918 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAG1P15918 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAG1P15918 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAG1P15918 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAG1P15918 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAG1P15918 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAG1P15918 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAG1P15918 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAG1P15918 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAG1P15918 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAG1P15918 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAG1P15918 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAG1P15918 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAG1P15918 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAG1P15918 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAG1P15918 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAG1P15918 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAG1P15918 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAG1P15918 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAG1P15918 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAG1P15918 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAG1P15918 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAG1P15918 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAG1P15918 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAG1P15918 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAG1P15918 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAG1P15918 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAG1P15918 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAG1P15918 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAG1P15918 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RAG1P15918 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAG1P15918 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAG1P15918 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAG1P15918 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAG1P15918 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RAG1P15918 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAG1P15918 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAG1P15918 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RAG1P15918 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAG1P15918 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAG1P15918 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAG1P15918 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RAG1P15918 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAG1P15918 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAG1P15918 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAG1P15918 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAG1P15918 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAG1P15918 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAG1P15918 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAG1P15918 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAG1P15918 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAG1P15918 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAG1P15918 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAG1P15918 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAG1P15918 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAG1P15918 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAG1P15918 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAG1P15918 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAG1P15918 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAG1P15918 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAG1P15918 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAG1P15918 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAG1P15918 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAG1P15918 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAG1P15918 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAG1P15918 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAG1P15918 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAG1P15918 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAG1P15918 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAG1P15918 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAG1P15918 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAG1P15918 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAG1P15918 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAG1P15918 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAG1P15918 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAG1P15918 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAG1P15918 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAG1P15918 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAG1P15918 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAG1P15918 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAG1P15918 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAG1P15918 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAG1P15918 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAG1P15918 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAG1P15918 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAG1P15918 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAG1P15918 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAG1P15918 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAG1P15918 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms