Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VEGFAP15692 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VEGFAP15692 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VEGFAP15692 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VEGFAP15692 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VEGFAP15692 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
VEGFAP15692 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms