Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYL1P12980 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYL1P12980 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYL1P12980 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYL1P12980 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYL1P12980 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYL1P12980 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYL1P12980 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYL1P12980 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYL1P12980 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYL1P12980 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYL1P12980 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYL1P12980 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYL1P12980 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LYL1P12980 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYL1P12980 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYL1P12980 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYL1P12980 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYL1P12980 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYL1P12980 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYL1P12980 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYL1P12980 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYL1P12980 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYL1P12980 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYL1P12980 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYL1P12980 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYL1P12980 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYL1P12980 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYL1P12980 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYL1P12980 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYL1P12980 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYL1P12980 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYL1P12980 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYL1P12980 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYL1P12980 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYL1P12980 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYL1P12980 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYL1P12980 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYL1P12980 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYL1P12980 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYL1P12980 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYL1P12980 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYL1P12980 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYL1P12980 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYL1P12980 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYL1P12980 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYL1P12980 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYL1P12980 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYL1P12980 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYL1P12980 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYL1P12980 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYL1P12980 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYL1P12980 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYL1P12980 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYL1P12980 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYL1P12980 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYL1P12980 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYL1P12980 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LYL1P12980 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LYL1P12980 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LYL1P12980 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LYL1P12980 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LYL1P12980 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LYL1P12980 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LYL1P12980 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LYL1P12980 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LYL1P12980 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LYL1P12980 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LYL1P12980 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LYL1P12980 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LYL1P12980 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LYL1P12980 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LYL1P12980 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LYL1P12980 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LYL1P12980 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LYL1P12980 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LYL1P12980 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LYL1P12980 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LYL1P12980 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LYL1P12980 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LYL1P12980 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LYL1P12980 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LYL1P12980 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LYL1P12980 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LYL1P12980 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LYL1P12980 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LYL1P12980 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LYL1P12980 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LYL1P12980 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LYL1P12980 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LYL1P12980 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LYL1P12980 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LYL1P12980 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LYL1P12980 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LYL1P12980 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LYL1P12980 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LYL1P12980 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LYL1P12980 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LYL1P12980 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LYL1P12980 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms