Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.11
TOP2AP11388 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC40.63■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.1
TOP2AP11388 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC40.62■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC40.62■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC40.6■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
TOP2AP11388 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms