Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP1P11387 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP1P11387 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP1P11387 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP1P11387 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP1P11387 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP1P11387 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP1P11387 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP1P11387 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP1P11387 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOP1P11387 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOP1P11387 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOP1P11387 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOP1P11387 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOP1P11387 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOP1P11387 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOP1P11387 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOP1P11387 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOP1P11387 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOP1P11387 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TOP1P11387 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TOP1P11387 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TOP1P11387 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOP1P11387 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOP1P11387 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOP1P11387 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOP1P11387 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOP1P11387 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOP1P11387 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOP1P11387 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOP1P11387 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOP1P11387 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOP1P11387 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOP1P11387 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOP1P11387 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOP1P11387 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOP1P11387 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOP1P11387 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOP1P11387 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOP1P11387 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOP1P11387 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOP1P11387 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOP1P11387 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOP1P11387 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP1P11387 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP1P11387 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP1P11387 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP1P11387 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP1P11387 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP1P11387 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP1P11387 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP1P11387 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP1P11387 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP1P11387 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP1P11387 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP1P11387 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP1P11387 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP1P11387 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP1P11387 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP1P11387 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP1P11387 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP1P11387 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP1P11387 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP1P11387 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP1P11387 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP1P11387 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP1P11387 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP1P11387 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP1P11387 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP1P11387 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP1P11387 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP1P11387 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP1P11387 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP1P11387 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP1P11387 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP1P11387 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP1P11387 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP1P11387 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP1P11387 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP1P11387 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP1P11387 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP1P11387 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP1P11387 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP1P11387 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP1P11387 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP1P11387 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP1P11387 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP1P11387 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP1P11387 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP1P11387 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP1P11387 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP1P11387 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP1P11387 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP1P11387 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP1P11387 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP1P11387 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP1P11387 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP1P11387 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP1P11387 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP1P11387 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms