Protein–RNA interactions for Protein: P11055

MYH3, Myosin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH3P11055 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYH3P11055 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYH3P11055 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYH3P11055 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
MYH3P11055 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MYH3P11055 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.16
MYH3P11055 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MYH3P11055 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYH3P11055 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYH3P11055 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MYH3P11055 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYH3P11055 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYH3P11055 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MYH3P11055 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYH3P11055 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYH3P11055 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYH3P11055 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYH3P11055 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYH3P11055 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYH3P11055 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYH3P11055 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYH3P11055 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYH3P11055 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYH3P11055 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYH3P11055 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYH3P11055 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYH3P11055 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYH3P11055 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYH3P11055 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYH3P11055 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYH3P11055 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYH3P11055 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYH3P11055 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYH3P11055 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYH3P11055 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYH3P11055 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYH3P11055 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYH3P11055 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYH3P11055 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYH3P11055 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYH3P11055 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYH3P11055 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MYH3P11055 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYH3P11055 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYH3P11055 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYH3P11055 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MYH3P11055 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYH3P11055 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MYH3P11055 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYH3P11055 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYH3P11055 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYH3P11055 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYH3P11055 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYH3P11055 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYH3P11055 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYH3P11055 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYH3P11055 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYH3P11055 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MYH3P11055 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MYH3P11055 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MYH3P11055 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MYH3P11055 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYH3P11055 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYH3P11055 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYH3P11055 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYH3P11055 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYH3P11055 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYH3P11055 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYH3P11055 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYH3P11055 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYH3P11055 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MYH3P11055 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYH3P11055 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYH3P11055 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYH3P11055 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MYH3P11055 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MYH3P11055 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYH3P11055 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYH3P11055 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH3P11055 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH3P11055 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH3P11055 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH3P11055 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH3P11055 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH3P11055 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH3P11055 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH3P11055 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH3P11055 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH3P11055 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH3P11055 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH3P11055 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH3P11055 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH3P11055 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH3P11055 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH3P11055 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH3P11055 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH3P11055 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH3P11055 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH3P11055 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH3P11055 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms