Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD28P10747 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD28P10747 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD28P10747 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD28P10747 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD28P10747 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD28P10747 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CD28P10747 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD28P10747 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD28P10747 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD28P10747 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD28P10747 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD28P10747 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD28P10747 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD28P10747 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD28P10747 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD28P10747 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD28P10747 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD28P10747 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD28P10747 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD28P10747 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD28P10747 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD28P10747 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD28P10747 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD28P10747 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD28P10747 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD28P10747 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD28P10747 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD28P10747 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD28P10747 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD28P10747 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD28P10747 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD28P10747 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD28P10747 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD28P10747 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD28P10747 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CD28P10747 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD28P10747 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD28P10747 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD28P10747 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD28P10747 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD28P10747 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD28P10747 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD28P10747 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD28P10747 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CD28P10747 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD28P10747 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD28P10747 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD28P10747 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD28P10747 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD28P10747 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CD28P10747 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD28P10747 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD28P10747 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD28P10747 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD28P10747 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD28P10747 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CD28P10747 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD28P10747 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD28P10747 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD28P10747 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD28P10747 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD28P10747 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD28P10747 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD28P10747 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CD28P10747 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD28P10747 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD28P10747 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD28P10747 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD28P10747 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD28P10747 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CD28P10747 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CD28P10747 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD28P10747 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CD28P10747 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD28P10747 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD28P10747 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD28P10747 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD28P10747 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD28P10747 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD28P10747 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD28P10747 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD28P10747 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD28P10747 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD28P10747 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CD28P10747 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD28P10747 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD28P10747 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD28P10747 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD28P10747 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD28P10747 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD28P10747 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD28P10747 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD28P10747 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD28P10747 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD28P10747 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD28P10747 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD28P10747 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD28P10747 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD28P10747 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms