Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NR2F1P10589 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NR2F1P10589 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR2F1P10589 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NR2F1P10589 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NR2F1P10589 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NR2F1P10589 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NR2F1P10589 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NR2F1P10589 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR2F1P10589 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR2F1P10589 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR2F1P10589 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR2F1P10589 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR2F1P10589 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR2F1P10589 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NR2F1P10589 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NR2F1P10589 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NR2F1P10589 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR2F1P10589 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR2F1P10589 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NR2F1P10589 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NR2F1P10589 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NR2F1P10589 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NR2F1P10589 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NR2F1P10589 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR2F1P10589 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR2F1P10589 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR2F1P10589 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR2F1P10589 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NR2F1P10589 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR2F1P10589 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NR2F1P10589 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NR2F1P10589 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR2F1P10589 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NR2F1P10589 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR2F1P10589 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NR2F1P10589 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR2F1P10589 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR2F1P10589 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NR2F1P10589 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR2F1P10589 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NR2F1P10589 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NR2F1P10589 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NR2F1P10589 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR2F1P10589 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR2F1P10589 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NR2F1P10589 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR2F1P10589 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NR2F1P10589 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR2F1P10589 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NR2F1P10589 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR2F1P10589 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NR2F1P10589 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR2F1P10589 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR2F1P10589 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR2F1P10589 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NR2F1P10589 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR2F1P10589 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR2F1P10589 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NR2F1P10589 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NR2F1P10589 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NR2F1P10589 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NR2F1P10589 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NR2F1P10589 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR2F1P10589 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR2F1P10589 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NR2F1P10589 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR2F1P10589 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR2F1P10589 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NR2F1P10589 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NR2F1P10589 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NR2F1P10589 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR2F1P10589 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
NR2F1P10589 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NR2F1P10589 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR2F1P10589 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms