Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VSIG8P0DPA2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VSIG8P0DPA2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VSIG8P0DPA2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VSIG8P0DPA2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VSIG8P0DPA2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VSIG8P0DPA2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VSIG8P0DPA2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VSIG8P0DPA2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VSIG8P0DPA2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VSIG8P0DPA2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VSIG8P0DPA2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VSIG8P0DPA2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VSIG8P0DPA2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VSIG8P0DPA2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VSIG8P0DPA2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VSIG8P0DPA2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VSIG8P0DPA2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VSIG8P0DPA2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VSIG8P0DPA2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VSIG8P0DPA2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VSIG8P0DPA2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VSIG8P0DPA2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VSIG8P0DPA2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms