Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CALM1P0DP23 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALM1P0DP23 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms