Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTAP09496 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTAP09496 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTAP09496 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTAP09496 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTAP09496 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTAP09496 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTAP09496 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLTAP09496 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLTAP09496 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLTAP09496 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLTAP09496 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLTAP09496 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLTAP09496 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTAP09496 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTAP09496 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTAP09496 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTAP09496 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTAP09496 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTAP09496 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTAP09496 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTAP09496 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTAP09496 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTAP09496 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLTAP09496 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLTAP09496 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLTAP09496 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLTAP09496 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLTAP09496 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLTAP09496 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLTAP09496 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLTAP09496 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLTAP09496 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTAP09496 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTAP09496 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTAP09496 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTAP09496 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTAP09496 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTAP09496 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTAP09496 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTAP09496 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTAP09496 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTAP09496 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTAP09496 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTAP09496 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTAP09496 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTAP09496 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTAP09496 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLTAP09496 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLTAP09496 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTAP09496 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTAP09496 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTAP09496 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTAP09496 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTAP09496 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTAP09496 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTAP09496 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTAP09496 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTAP09496 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTAP09496 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTAP09496 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTAP09496 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTAP09496 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTAP09496 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTAP09496 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTAP09496 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTAP09496 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTAP09496 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTAP09496 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTAP09496 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTAP09496 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTAP09496 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTAP09496 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTAP09496 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTAP09496 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTAP09496 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTAP09496 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTAP09496 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTAP09496 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTAP09496 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTAP09496 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTAP09496 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTAP09496 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTAP09496 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTAP09496 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTAP09496 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTAP09496 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTAP09496 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTAP09496 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTAP09496 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTAP09496 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTAP09496 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTAP09496 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTAP09496 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTAP09496 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTAP09496 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTAP09496 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTAP09496 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTAP09496 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTAP09496 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms