Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LDHBP07195 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LDHBP07195 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LDHBP07195 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LDHBP07195 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LDHBP07195 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LDHBP07195 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LDHBP07195 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LDHBP07195 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LDHBP07195 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LDHBP07195 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LDHBP07195 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LDHBP07195 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LDHBP07195 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LDHBP07195 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDHBP07195 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDHBP07195 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDHBP07195 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDHBP07195 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDHBP07195 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDHBP07195 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDHBP07195 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDHBP07195 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LDHBP07195 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDHBP07195 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDHBP07195 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDHBP07195 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDHBP07195 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LDHBP07195 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LDHBP07195 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LDHBP07195 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LDHBP07195 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LDHBP07195 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LDHBP07195 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LDHBP07195 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LDHBP07195 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LDHBP07195 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LDHBP07195 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LDHBP07195 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LDHBP07195 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LDHBP07195 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LDHBP07195 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LDHBP07195 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LDHBP07195 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LDHBP07195 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDHBP07195 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDHBP07195 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDHBP07195 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDHBP07195 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LDHBP07195 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDHBP07195 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDHBP07195 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LDHBP07195 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LDHBP07195 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LDHBP07195 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LDHBP07195 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LDHBP07195 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LDHBP07195 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LDHBP07195 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LDHBP07195 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LDHBP07195 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LDHBP07195 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LDHBP07195 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LDHBP07195 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LDHBP07195 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LDHBP07195 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LDHBP07195 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LDHBP07195 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LDHBP07195 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LDHBP07195 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LDHBP07195 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LDHBP07195 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LDHBP07195 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LDHBP07195 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LDHBP07195 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LDHBP07195 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LDHBP07195 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LDHBP07195 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LDHBP07195 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LDHBP07195 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LDHBP07195 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LDHBP07195 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LDHBP07195 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LDHBP07195 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LDHBP07195 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LDHBP07195 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LDHBP07195 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LDHBP07195 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LDHBP07195 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LDHBP07195 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LDHBP07195 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LDHBP07195 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LDHBP07195 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LDHBP07195 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LDHBP07195 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LDHBP07195 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LDHBP07195 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LDHBP07195 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LDHBP07195 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LDHBP07195 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms