Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms