Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DRAP01903 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms