Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD3O95983 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD3O95983 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD3O95983 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD3O95983 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD3O95983 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD3O95983 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD3O95983 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD3O95983 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD3O95983 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD3O95983 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD3O95983 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD3O95983 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD3O95983 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD3O95983 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD3O95983 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD3O95983 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD3O95983 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD3O95983 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD3O95983 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD3O95983 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD3O95983 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD3O95983 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD3O95983 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD3O95983 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD3O95983 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD3O95983 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD3O95983 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD3O95983 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD3O95983 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD3O95983 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD3O95983 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD3O95983 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD3O95983 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD3O95983 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD3O95983 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD3O95983 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD3O95983 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD3O95983 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD3O95983 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD3O95983 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD3O95983 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD3O95983 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD3O95983 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD3O95983 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD3O95983 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD3O95983 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD3O95983 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD3O95983 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD3O95983 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MBD3O95983 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MBD3O95983 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MBD3O95983 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MBD3O95983 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MBD3O95983 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MBD3O95983 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD3O95983 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD3O95983 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD3O95983 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD3O95983 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD3O95983 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD3O95983 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD3O95983 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD3O95983 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD3O95983 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD3O95983 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD3O95983 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD3O95983 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD3O95983 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD3O95983 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD3O95983 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD3O95983 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD3O95983 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD3O95983 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD3O95983 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD3O95983 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD3O95983 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD3O95983 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD3O95983 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD3O95983 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD3O95983 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD3O95983 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD3O95983 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD3O95983 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MBD3O95983 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MBD3O95983 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MBD3O95983 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MBD3O95983 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MBD3O95983 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MBD3O95983 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MBD3O95983 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MBD3O95983 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MBD3O95983 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MBD3O95983 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD3O95983 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD3O95983 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD3O95983 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD3O95983 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD3O95983 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD3O95983 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms