Protein–RNA interactions for Protein: O95947

TBX6, T-box transcription factor TBX6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX6O95947 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TBX6O95947 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBX6O95947 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBX6O95947 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBX6O95947 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBX6O95947 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBX6O95947 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBX6O95947 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBX6O95947 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBX6O95947 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBX6O95947 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBX6O95947 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBX6O95947 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TBX6O95947 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TBX6O95947 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TBX6O95947 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBX6O95947 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBX6O95947 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBX6O95947 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBX6O95947 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBX6O95947 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBX6O95947 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TBX6O95947 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBX6O95947 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBX6O95947 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBX6O95947 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TBX6O95947 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX6O95947 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX6O95947 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX6O95947 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX6O95947 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX6O95947 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX6O95947 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX6O95947 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX6O95947 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX6O95947 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX6O95947 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX6O95947 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX6O95947 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX6O95947 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX6O95947 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX6O95947 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX6O95947 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX6O95947 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBX6O95947 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBX6O95947 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBX6O95947 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBX6O95947 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBX6O95947 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBX6O95947 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBX6O95947 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBX6O95947 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBX6O95947 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBX6O95947 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX6O95947 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX6O95947 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX6O95947 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX6O95947 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX6O95947 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX6O95947 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX6O95947 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX6O95947 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX6O95947 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX6O95947 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX6O95947 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX6O95947 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX6O95947 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX6O95947 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX6O95947 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX6O95947 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX6O95947 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX6O95947 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX6O95947 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TBX6O95947 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TBX6O95947 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TBX6O95947 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TBX6O95947 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TBX6O95947 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TBX6O95947 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TBX6O95947 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TBX6O95947 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TBX6O95947 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TBX6O95947 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TBX6O95947 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TBX6O95947 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TBX6O95947 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TBX6O95947 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TBX6O95947 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TBX6O95947 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TBX6O95947 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TBX6O95947 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBX6O95947 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBX6O95947 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBX6O95947 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TBX6O95947 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBX6O95947 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBX6O95947 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBX6O95947 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBX6O95947 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBX6O95947 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms