Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLIC3O95833 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLIC3O95833 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CLIC3O95833 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLIC3O95833 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLIC3O95833 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIC3O95833 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLIC3O95833 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms