Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSL3O95573 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms