Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX6O95503 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX6O95503 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX6O95503 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX6O95503 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX6O95503 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX6O95503 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX6O95503 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX6O95503 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX6O95503 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX6O95503 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX6O95503 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX6O95503 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX6O95503 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX6O95503 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX6O95503 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX6O95503 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX6O95503 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX6O95503 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX6O95503 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX6O95503 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX6O95503 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX6O95503 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX6O95503 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX6O95503 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX6O95503 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX6O95503 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX6O95503 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX6O95503 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX6O95503 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX6O95503 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CBX6O95503 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CBX6O95503 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CBX6O95503 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CBX6O95503 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBX6O95503 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBX6O95503 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBX6O95503 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBX6O95503 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBX6O95503 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBX6O95503 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBX6O95503 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX6O95503 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX6O95503 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX6O95503 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX6O95503 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX6O95503 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX6O95503 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX6O95503 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX6O95503 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX6O95503 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX6O95503 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX6O95503 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX6O95503 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX6O95503 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX6O95503 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX6O95503 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX6O95503 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX6O95503 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX6O95503 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX6O95503 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX6O95503 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX6O95503 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX6O95503 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX6O95503 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX6O95503 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX6O95503 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX6O95503 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX6O95503 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX6O95503 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX6O95503 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX6O95503 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX6O95503 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX6O95503 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX6O95503 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX6O95503 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX6O95503 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX6O95503 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX6O95503 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX6O95503 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX6O95503 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX6O95503 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX6O95503 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX6O95503 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX6O95503 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX6O95503 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX6O95503 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX6O95503 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX6O95503 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX6O95503 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX6O95503 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX6O95503 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX6O95503 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX6O95503 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX6O95503 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX6O95503 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX6O95503 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX6O95503 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX6O95503 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX6O95503 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms