Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX4O95219 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX4O95219 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX4O95219 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX4O95219 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX4O95219 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX4O95219 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX4O95219 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX4O95219 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX4O95219 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX4O95219 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX4O95219 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX4O95219 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX4O95219 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX4O95219 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX4O95219 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX4O95219 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX4O95219 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX4O95219 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX4O95219 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX4O95219 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX4O95219 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX4O95219 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX4O95219 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX4O95219 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX4O95219 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX4O95219 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX4O95219 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX4O95219 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX4O95219 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX4O95219 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX4O95219 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX4O95219 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX4O95219 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX4O95219 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX4O95219 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX4O95219 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX4O95219 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX4O95219 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX4O95219 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX4O95219 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX4O95219 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX4O95219 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SNX4O95219 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX4O95219 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX4O95219 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX4O95219 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX4O95219 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX4O95219 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX4O95219 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX4O95219 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX4O95219 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX4O95219 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX4O95219 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX4O95219 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX4O95219 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX4O95219 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX4O95219 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX4O95219 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX4O95219 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX4O95219 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX4O95219 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX4O95219 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX4O95219 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNX4O95219 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNX4O95219 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX4O95219 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX4O95219 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX4O95219 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX4O95219 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX4O95219 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX4O95219 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX4O95219 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX4O95219 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX4O95219 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX4O95219 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX4O95219 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX4O95219 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX4O95219 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX4O95219 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX4O95219 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX4O95219 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX4O95219 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX4O95219 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX4O95219 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX4O95219 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX4O95219 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX4O95219 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX4O95219 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX4O95219 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX4O95219 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX4O95219 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX4O95219 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX4O95219 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX4O95219 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX4O95219 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX4O95219 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX4O95219 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX4O95219 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX4O95219 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms