Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN3O95197 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN3O95197 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN3O95197 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN3O95197 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN3O95197 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN3O95197 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN3O95197 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN3O95197 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN3O95197 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN3O95197 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN3O95197 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN3O95197 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN3O95197 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN3O95197 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN3O95197 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN3O95197 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN3O95197 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN3O95197 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN3O95197 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN3O95197 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN3O95197 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN3O95197 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN3O95197 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN3O95197 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN3O95197 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN3O95197 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN3O95197 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN3O95197 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN3O95197 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN3O95197 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN3O95197 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN3O95197 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN3O95197 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN3O95197 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN3O95197 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN3O95197 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN3O95197 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN3O95197 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN3O95197 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN3O95197 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN3O95197 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN3O95197 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN3O95197 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN3O95197 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN3O95197 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN3O95197 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN3O95197 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN3O95197 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN3O95197 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN3O95197 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN3O95197 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTN3O95197 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTN3O95197 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTN3O95197 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RTN3O95197 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTN3O95197 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN3O95197 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN3O95197 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN3O95197 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN3O95197 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN3O95197 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN3O95197 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN3O95197 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN3O95197 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN3O95197 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN3O95197 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN3O95197 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN3O95197 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN3O95197 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN3O95197 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN3O95197 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN3O95197 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN3O95197 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN3O95197 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN3O95197 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN3O95197 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN3O95197 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN3O95197 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN3O95197 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN3O95197 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN3O95197 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN3O95197 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN3O95197 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN3O95197 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN3O95197 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN3O95197 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN3O95197 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN3O95197 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN3O95197 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN3O95197 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN3O95197 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN3O95197 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN3O95197 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN3O95197 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN3O95197 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN3O95197 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN3O95197 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN3O95197 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN3O95197 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms