Protein–RNA interactions for Protein: O95183

VAMP5, Vesicle-associated membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP5O95183 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAMP5O95183 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAMP5O95183 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP5O95183 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP5O95183 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP5O95183 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP5O95183 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP5O95183 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP5O95183 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP5O95183 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP5O95183 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP5O95183 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAMP5O95183 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAMP5O95183 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAMP5O95183 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAMP5O95183 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms