Protein–RNA interactions for Protein: O94967

WDR47, WD repeat-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR47O94967 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR47O94967 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR47O94967 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR47O94967 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR47O94967 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR47O94967 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR47O94967 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR47O94967 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR47O94967 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR47O94967 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR47O94967 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR47O94967 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR47O94967 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR47O94967 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR47O94967 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR47O94967 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR47O94967 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR47O94967 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR47O94967 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR47O94967 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR47O94967 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR47O94967 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR47O94967 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR47O94967 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR47O94967 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR47O94967 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR47O94967 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR47O94967 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR47O94967 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR47O94967 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR47O94967 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR47O94967 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR47O94967 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR47O94967 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR47O94967 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR47O94967 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR47O94967 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR47O94967 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR47O94967 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR47O94967 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR47O94967 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR47O94967 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR47O94967 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR47O94967 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR47O94967 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR47O94967 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR47O94967 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
WDR47O94967 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR47O94967 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR47O94967 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR47O94967 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR47O94967 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR47O94967 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR47O94967 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR47O94967 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR47O94967 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR47O94967 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR47O94967 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR47O94967 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR47O94967 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR47O94967 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR47O94967 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR47O94967 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR47O94967 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR47O94967 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR47O94967 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR47O94967 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR47O94967 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR47O94967 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR47O94967 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR47O94967 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR47O94967 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR47O94967 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR47O94967 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR47O94967 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR47O94967 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR47O94967 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR47O94967 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR47O94967 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR47O94967 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR47O94967 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR47O94967 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR47O94967 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR47O94967 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR47O94967 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR47O94967 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR47O94967 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR47O94967 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR47O94967 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR47O94967 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR47O94967 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR47O94967 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR47O94967 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR47O94967 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR47O94967 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR47O94967 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR47O94967 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR47O94967 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR47O94967 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR47O94967 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms