Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG12O94817 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG12O94817 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG12O94817 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG12O94817 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG12O94817 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG12O94817 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG12O94817 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG12O94817 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG12O94817 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG12O94817 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG12O94817 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG12O94817 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG12O94817 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG12O94817 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG12O94817 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG12O94817 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG12O94817 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG12O94817 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG12O94817 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG12O94817 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG12O94817 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG12O94817 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG12O94817 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG12O94817 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG12O94817 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG12O94817 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG12O94817 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG12O94817 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG12O94817 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG12O94817 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG12O94817 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG12O94817 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG12O94817 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG12O94817 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG12O94817 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG12O94817 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG12O94817 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG12O94817 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG12O94817 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG12O94817 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG12O94817 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG12O94817 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG12O94817 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG12O94817 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG12O94817 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG12O94817 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG12O94817 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG12O94817 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG12O94817 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG12O94817 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG12O94817 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATG12O94817 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATG12O94817 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG12O94817 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG12O94817 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG12O94817 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG12O94817 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG12O94817 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG12O94817 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG12O94817 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG12O94817 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG12O94817 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG12O94817 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG12O94817 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG12O94817 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG12O94817 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG12O94817 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG12O94817 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG12O94817 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG12O94817 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG12O94817 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG12O94817 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG12O94817 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG12O94817 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG12O94817 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG12O94817 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG12O94817 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG12O94817 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG12O94817 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG12O94817 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG12O94817 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG12O94817 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG12O94817 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG12O94817 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG12O94817 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG12O94817 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG12O94817 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG12O94817 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG12O94817 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG12O94817 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG12O94817 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG12O94817 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG12O94817 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG12O94817 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG12O94817 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG12O94817 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG12O94817 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG12O94817 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG12O94817 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms