Protein–RNA interactions for Protein: O76070

SNCG, Gamma-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCGO76070 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCGO76070 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCGO76070 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCGO76070 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNCGO76070 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNCGO76070 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNCGO76070 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNCGO76070 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCGO76070 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCGO76070 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCGO76070 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCGO76070 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCGO76070 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCGO76070 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCGO76070 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCGO76070 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCGO76070 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCGO76070 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCGO76070 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCGO76070 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCGO76070 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCGO76070 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCGO76070 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCGO76070 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCGO76070 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCGO76070 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCGO76070 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCGO76070 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCGO76070 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCGO76070 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCGO76070 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCGO76070 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCGO76070 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCGO76070 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCGO76070 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCGO76070 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCGO76070 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCGO76070 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCGO76070 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCGO76070 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCGO76070 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCGO76070 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCGO76070 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCGO76070 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCGO76070 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCGO76070 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCGO76070 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCGO76070 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCGO76070 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCGO76070 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCGO76070 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCGO76070 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCGO76070 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCGO76070 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCGO76070 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCGO76070 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCGO76070 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCGO76070 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCGO76070 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCGO76070 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCGO76070 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCGO76070 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCGO76070 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCGO76070 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCGO76070 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCGO76070 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCGO76070 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCGO76070 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCGO76070 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCGO76070 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCGO76070 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCGO76070 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCGO76070 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCGO76070 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCGO76070 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCGO76070 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCGO76070 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCGO76070 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCGO76070 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCGO76070 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCGO76070 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCGO76070 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCGO76070 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCGO76070 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCGO76070 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCGO76070 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCGO76070 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCGO76070 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCGO76070 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCGO76070 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCGO76070 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCGO76070 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCGO76070 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCGO76070 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCGO76070 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCGO76070 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCGO76070 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCGO76070 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCGO76070 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCGO76070 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms