Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BBOX1O75936 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BBOX1O75936 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
BBOX1O75936 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BBOX1O75936 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BBOX1O75936 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BBOX1O75936 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BBOX1O75936 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BBOX1O75936 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BBOX1O75936 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
BBOX1O75936 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BBOX1O75936 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BBOX1O75936 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms