Protein–RNA interactions for Protein: O75838

CIB2, Calcium and integrin-binding family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB2O75838 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIB2O75838 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIB2O75838 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIB2O75838 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIB2O75838 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIB2O75838 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIB2O75838 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIB2O75838 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIB2O75838 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIB2O75838 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CIB2O75838 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIB2O75838 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIB2O75838 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIB2O75838 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIB2O75838 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIB2O75838 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CIB2O75838 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIB2O75838 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIB2O75838 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIB2O75838 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIB2O75838 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIB2O75838 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIB2O75838 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIB2O75838 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIB2O75838 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIB2O75838 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CIB2O75838 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIB2O75838 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIB2O75838 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIB2O75838 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIB2O75838 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIB2O75838 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIB2O75838 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIB2O75838 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIB2O75838 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIB2O75838 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIB2O75838 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIB2O75838 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIB2O75838 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIB2O75838 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIB2O75838 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIB2O75838 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CIB2O75838 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIB2O75838 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIB2O75838 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIB2O75838 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CIB2O75838 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIB2O75838 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIB2O75838 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIB2O75838 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIB2O75838 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIB2O75838 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIB2O75838 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIB2O75838 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIB2O75838 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CIB2O75838 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIB2O75838 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIB2O75838 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIB2O75838 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIB2O75838 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIB2O75838 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIB2O75838 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIB2O75838 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIB2O75838 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIB2O75838 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIB2O75838 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIB2O75838 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIB2O75838 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIB2O75838 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIB2O75838 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIB2O75838 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIB2O75838 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIB2O75838 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIB2O75838 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIB2O75838 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIB2O75838 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CIB2O75838 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIB2O75838 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIB2O75838 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIB2O75838 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIB2O75838 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIB2O75838 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIB2O75838 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIB2O75838 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIB2O75838 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIB2O75838 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIB2O75838 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIB2O75838 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIB2O75838 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIB2O75838 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIB2O75838 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIB2O75838 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIB2O75838 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIB2O75838 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIB2O75838 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CIB2O75838 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIB2O75838 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIB2O75838 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIB2O75838 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIB2O75838 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms