Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF10O60809 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF10O60809 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF10O60809 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF10O60809 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF10O60809 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF10O60809 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF10O60809 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF10O60809 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF10O60809 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF10O60809 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF10O60809 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF10O60809 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF10O60809 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF10O60809 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF10O60809 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF10O60809 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF10O60809 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms