Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC46.59■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC46.59■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC46.59■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC46.59■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.59■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.58■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC46.58■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC46.57■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC46.57■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.57■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC46.56■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC46.56■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC46.55■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC46.54■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC46.54■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC46.54■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.54■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC46.54■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC46.53■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC46.53■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.52■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.52■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC46.52■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC46.52■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC46.52■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.52■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC46.51■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC46.51■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC46.51■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
ABCC9O60706 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
ABCC9O60706 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
ABCC9O60706 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC46.48■■■■■ 5.03
ABCC9O60706 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
ABCC9O60706 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC46.47■■■■■ 5.03
ABCC9O60706 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC46.47■■■■■ 5.03
ABCC9O60706 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC46.47■■■■■ 5.03
ABCC9O60706 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
ABCC9O60706 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
ABCC9O60706 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC46.46■■■■■ 5.03
ABCC9O60706 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC46.46■■■■■ 5.03
ABCC9O60706 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
ABCC9O60706 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC46.45■■■■■ 5.03
ABCC9O60706 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC46.45■■■■■ 5.03
ABCC9O60706 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC46.45■■■■■ 5.03
ABCC9O60706 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC46.45■■■■■ 5.03
ABCC9O60706 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC46.44■■■■■ 5.03
ABCC9O60706 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC46.44■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC46.43■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC46.43■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC46.43■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC46.43■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.42■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC46.42■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC46.42■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC46.41■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC46.41■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.41■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC46.41■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC46.41■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.38■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.02
ABCC9O60706 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC46.38■■■■■ 5.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms