Protein–RNA interactions for Protein: O60684

KPNA6, Importin subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA6O60684 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KPNA6O60684 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KPNA6O60684 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KPNA6O60684 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KPNA6O60684 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KPNA6O60684 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KPNA6O60684 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KPNA6O60684 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KPNA6O60684 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KPNA6O60684 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KPNA6O60684 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KPNA6O60684 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KPNA6O60684 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KPNA6O60684 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms