Protein–RNA interactions for Protein: O60568

PLOD3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD3O60568 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLOD3O60568 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLOD3O60568 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLOD3O60568 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD3O60568 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD3O60568 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD3O60568 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD3O60568 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD3O60568 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD3O60568 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD3O60568 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD3O60568 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLOD3O60568 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLOD3O60568 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLOD3O60568 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLOD3O60568 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLOD3O60568 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLOD3O60568 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PLOD3O60568 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms