Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRICKLE3O43900 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRICKLE3O43900 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.7 ms