Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCXO43602 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCXO43602 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCXO43602 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCXO43602 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCXO43602 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCXO43602 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCXO43602 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCXO43602 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCXO43602 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCXO43602 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCXO43602 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCXO43602 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCXO43602 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCXO43602 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCXO43602 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCXO43602 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCXO43602 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DCXO43602 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DCXO43602 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCXO43602 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCXO43602 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCXO43602 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCXO43602 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCXO43602 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCXO43602 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCXO43602 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCXO43602 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCXO43602 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCXO43602 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCXO43602 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCXO43602 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCXO43602 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCXO43602 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DCXO43602 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCXO43602 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCXO43602 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCXO43602 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCXO43602 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCXO43602 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCXO43602 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCXO43602 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCXO43602 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCXO43602 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DCXO43602 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DCXO43602 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCXO43602 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCXO43602 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCXO43602 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCXO43602 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCXO43602 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCXO43602 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCXO43602 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCXO43602 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DCXO43602 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCXO43602 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCXO43602 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCXO43602 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCXO43602 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCXO43602 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCXO43602 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCXO43602 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCXO43602 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCXO43602 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCXO43602 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCXO43602 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCXO43602 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCXO43602 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCXO43602 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DCXO43602 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCXO43602 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCXO43602 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DCXO43602 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DCXO43602 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCXO43602 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCXO43602 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCXO43602 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCXO43602 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCXO43602 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCXO43602 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCXO43602 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCXO43602 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCXO43602 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCXO43602 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCXO43602 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCXO43602 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCXO43602 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCXO43602 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCXO43602 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCXO43602 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCXO43602 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCXO43602 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCXO43602 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCXO43602 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCXO43602 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCXO43602 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCXO43602 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DCXO43602 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCXO43602 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCXO43602 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms