Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DENRO43583 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DENRO43583 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DENRO43583 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DENRO43583 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DENRO43583 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DENRO43583 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DENRO43583 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DENRO43583 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DENRO43583 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DENRO43583 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DENRO43583 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DENRO43583 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DENRO43583 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DENRO43583 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DENRO43583 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DENRO43583 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DENRO43583 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DENRO43583 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DENRO43583 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DENRO43583 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DENRO43583 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DENRO43583 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DENRO43583 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DENRO43583 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DENRO43583 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DENRO43583 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DENRO43583 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DENRO43583 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DENRO43583 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DENRO43583 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DENRO43583 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DENRO43583 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DENRO43583 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DENRO43583 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DENRO43583 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DENRO43583 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DENRO43583 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DENRO43583 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DENRO43583 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DENRO43583 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DENRO43583 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DENRO43583 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DENRO43583 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DENRO43583 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DENRO43583 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DENRO43583 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DENRO43583 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DENRO43583 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DENRO43583 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DENRO43583 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DENRO43583 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DENRO43583 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DENRO43583 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DENRO43583 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DENRO43583 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DENRO43583 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DENRO43583 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DENRO43583 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DENRO43583 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DENRO43583 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DENRO43583 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DENRO43583 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DENRO43583 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DENRO43583 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DENRO43583 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DENRO43583 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DENRO43583 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DENRO43583 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DENRO43583 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DENRO43583 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DENRO43583 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DENRO43583 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DENRO43583 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DENRO43583 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DENRO43583 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DENRO43583 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DENRO43583 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DENRO43583 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DENRO43583 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DENRO43583 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DENRO43583 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DENRO43583 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DENRO43583 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DENRO43583 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DENRO43583 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DENRO43583 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DENRO43583 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DENRO43583 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DENRO43583 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DENRO43583 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DENRO43583 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DENRO43583 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DENRO43583 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DENRO43583 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DENRO43583 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DENRO43583 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DENRO43583 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DENRO43583 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DENRO43583 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms