Protein–RNA interactions for Protein: O43561

LAT, Linker for activation of T-cells family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATO43561 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LATO43561 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LATO43561 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LATO43561 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LATO43561 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LATO43561 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LATO43561 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LATO43561 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LATO43561 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LATO43561 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LATO43561 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LATO43561 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LATO43561 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LATO43561 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LATO43561 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LATO43561 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LATO43561 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LATO43561 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LATO43561 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LATO43561 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LATO43561 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LATO43561 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LATO43561 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LATO43561 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LATO43561 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LATO43561 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LATO43561 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LATO43561 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LATO43561 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LATO43561 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LATO43561 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LATO43561 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LATO43561 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LATO43561 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LATO43561 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LATO43561 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LATO43561 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LATO43561 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LATO43561 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LATO43561 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LATO43561 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LATO43561 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LATO43561 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LATO43561 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LATO43561 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LATO43561 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LATO43561 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LATO43561 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LATO43561 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LATO43561 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LATO43561 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LATO43561 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LATO43561 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LATO43561 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LATO43561 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LATO43561 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LATO43561 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LATO43561 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LATO43561 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LATO43561 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LATO43561 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LATO43561 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LATO43561 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LATO43561 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LATO43561 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LATO43561 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LATO43561 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LATO43561 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LATO43561 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LATO43561 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LATO43561 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LATO43561 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LATO43561 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LATO43561 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LATO43561 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LATO43561 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LATO43561 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LATO43561 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LATO43561 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LATO43561 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LATO43561 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LATO43561 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LATO43561 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LATO43561 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LATO43561 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LATO43561 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LATO43561 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LATO43561 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LATO43561 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LATO43561 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LATO43561 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LATO43561 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LATO43561 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LATO43561 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LATO43561 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LATO43561 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LATO43561 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LATO43561 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LATO43561 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LATO43561 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms