Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CBFA2T2O43439 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CBFA2T2O43439 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms