Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms